- i -

• IdentifyUnmatchedSSEs() : ssm::Superpose
• Init() : ssm::MAStruct , ssm::MAOutput , ssm::MAMap , ssm::MSSEOutput , ssm::SuperposeData
• InitAlign() : ssm::Align
• InitEdge() : ssm::Edge
• InitGraph() : ssm::Graph
• InitGraphMatch() : ssm::GraphMatch
• Initialize() : ssm::GraphMatch
• InitMatch() : ssm::Match
• InitMultAlign() : ssm::MultAlign
• InitSuperpose() : ssm::Superpose
• InitVertex() : ssm::Vertex
• inRange() : ssm::Graph , ssm::Vertex
• isBuild() : ssm::Graph
• isMatch() : ssm::Match
• isMC() : ssm::MAStruct , ssm::Superpose
• isSubMatch() : ssm::Match