#!/bin/csh -f
#
protin 				\
XYZIN ../data/takaxp_model8_b.pdb	\
PROTOUT ../data/protout.dat		\
PROTCOUNTS ../data/counts.dat		\
<< 'END-protin ' | col -b
TITLE REFINE TAKAXP_MODEL7_9.PDB
CHNNAM ID A CHNTYP 1
CHNNAM ID B CHNTYP 2
CHNTYP 1 NTERM 1 ALA 3 CTERM 476 SER 2
CHNTYP 1 DISUL 4 30 38 150 164 240 283 440 475
CHNTYP 1 CISPRO 2 139 341
CHNTYP 2 WAT 
PEPP 4 
SYMM 19
VDWRadii 1 CA 7 3.8
VDWCUT 5
CONTACTS 
END
'END-protin '